北京同仁医院中医科成立于同仁医院建院初期，曾涌现出翟济生、董怀一等数位国内知名老中医，现有在职专家两名，退休返聘专家九名，著名老中医孔嗣伯专家（中国近代“四大名医”孔伯华三子）现在中医特需门诊出诊。科室目前有在职职工11人，临床治疗专长覆盖内外妇儿诸科，可应用中药治疗各种眼科疾病，肾病、心脑血管、呼吸系统、消化系统、内分泌系统等内科杂病，肿瘤、妇科、外科、皮科、儿科、男科等疾病，对现代人工作生活压力大造成的慢性疲劳综合症、抑郁-焦虑状态、亚健康状态也有很好的综合调理治疗。除医疗任务外，中医科还担负北京首都医科大学、北京京华医科大学等医学院校医学生的中医教学及临床实习。
为适应社会各阶层的不同医疗需求，2004年起中医科在同仁东院开辟中医专家特需服务，采取门诊预约，助理协诊形式，为国内外疑难病患者提供服务。2005年起在同仁医院亦庄南院开展中医针灸门诊。
门诊草药来源于同仁医院三产怡然堂药店，是东城区优质示范药店，药品品种齐全，现有中药饮片及名贵细料药500余种，所有药品供货单位均为国家GMP认证饮片生产企业，药品调剂人员持证上岗，可代煎中药，异地邮购，确保患者得到优质可信的服务。
门诊电话：58268082（普通门诊） 58269759（特需门诊）58266960（亦庄南院门诊）
门诊地址：
普通门诊：北京市东城区东交民巷1号北京同仁医院东院外中医楼一层（北京市眼耳鼻喉研究所北边）
特需门诊：北京市东城区东交民巷1号北京同仁医院东院4层416室
亦庄南院门诊：北京同仁医院亦庄南院二层综合门诊中医科
门诊时间：
普通门诊：周一至周五8AM~5PM 周六、周日8AM~12PM
特需门诊：周一至周五8AM~5PM（电话预约）
亦庄南院门诊：周一至周五8AM~5PM
门诊网址：http://www.trhos.com/
交 通：地铁、103、104、106、116、60、44、48、39、41、3、703、848、和8路公共电汽车崇文门站，前往南院可在同仁医院搭乘患者班车。