普通外科自建院以来即成为重点科室，并得到良好的发展。60年代开始的胆结石成因和防治的研究多次获得卫生部和北京市的科技进步奖。70年代后对门脉高压症的外科治疗进行了深入的研究，首创了肠腔分流术，在国内外有很大的影响。90年代初，在国内首先开展腹腔镜外科，可在腔镜下进行胆囊、阑尾、疝、胃、结直肠癌、肝脏切除等手术，并且培养了一大批专门人才。90年代后期开始肝移植工作，手术成功率和病人生存期、生存质量在全国名列前茅。目前普通外科在肝移植、门脉高压症、肝癌、重症胰腺炎、肝内外胆管结石、胆道肿瘤和胃、结直肠癌的腔镜手术等方面均居于国内领先地位。