1941年12月日本偷袭在珍珠港的美国驻军，太平洋战争暴发,原北京协和医学院（现中国协和医科大学）因为和美国所协办，受其影响被迫停学。1942许英魁教授（第一届中华医学会神经精神科学会主任委员，《中华神经精神科杂志》第一届、第二届编辑委员会总编辑）被北京大学医学院聘请为神经科教授、主任。当时科里还有赵葆荀教授、王绩古教授,曹天祥教授等。1948年北京协和医学院恢复开学，1949年许英魁教授受上级指派带赵葆荀、王绩估等又返回北京协和医学院,留陳文俊教授、王芷沅教授、曹天祥教授在北京大学医学院神经科，王芷沅教授主要从事精神科专业研究，陳文俊教授、曹天祥教授从事神经科专业研究。1952年伍正谊教授来主持精神科並独立成精神科。1954年神经科独立建科,由陳文俊教授任独立建科后的第一届主任。

发展状况

自1954年从内科分出独立建科，有医师6人，病床9张。

1958年病房床位扩至36张，建立科内第一个实验室－脑电图室。

1960年病床又增至45张，并增建肌电图室、神经病理室，购置显微镜和切片机。 '文革时期'神经科又并入大内科，部分人员加入当时的'新医门诊'。

1978年又独立为神经科，开始筹建神经外科及相继建立各实验室：陈清棠教授、吴丽娟教授建立神经病理室；吴逊教授、孙相如教授建立神经电生理室，开展脑电、肌电及诱发电位等检查；1980年袁锦楣教授筹建神经免疫室；1984年伍期专教授筹建神经生化室；1985年高素荣教授建立神经心理室；赵玉宾教授建立神经耳科室，研究眩晕的临床。

1982年成立神经外科，1989年神经外科正式从神经科分出独立建科。
自1978年以来，各研究室的水平迅速提高，居国内领先，1978年设硕士点。

1986年神经内科在门诊开设：肌肉病门诊、癫痫门诊、帕金森病门诊、痴呆门诊等专业门诊。诊治水平居全国领先。另辟特需门诊。 1992年设博士点。

1996年经院领导审批，由神经内科、神经外科和小儿神经科的诸研究室联合建立'神经病学研究中心'，下属包括：神经病理室、神经电生理室、神经生化室、神经免疫室、神经心理室、神经药理、神经发育、分子遗传及神经外科研究室等9个研究室。