病理科是我院重要临床辅助科室之一。病理科承担着本院及合作医院的全部组织病理学和细胞病理学诊断工作、院际间肿瘤疑难病理会诊工作。平均每年完成本院临床外检病理诊断17000余例，细胞学诊断18000余例，来自国内外其他医院的院际间疑难病理会诊10000余例。在长期的肿瘤病理实践中，与临床密切合作，形成了对各种肿瘤主体、肿瘤旁和引流区淋巴结全面检查、充分取材、详细记录的优良传统，并建立了具有特色的细胞学诊断体系，为不断提高诊断水平和学科发展奠定了坚实的基础。建立与开展了免疫组织化学、电镜、图象分析、流式细胞分析以及分子病理学等辅助诊断技术及其相关的临床应用研究。
　　本科室是中国协和医科大学硕士和博士学位研究生培养点，共有博士学位研究生指导教师3人，硕士学位研究生指导教师6人，已经毕业和在读的硕士/博士研究生分别为15名和10名；这里还是病理住院医师以及高级病理诊断医师的培训基地，每年要完成计划安排的病理住院医师培训以及各科住院医师和轮转研究生培训工作，还接收来自全国大中型医院的进修医师10人左右。
　　历年来我科承担及完成了多项国家级、部级和院所级研究项目，包括我国以地域性肿瘤高发人群现场为基地的主要常见肿瘤病种的研究，如宫颈癌、肝癌、食管癌、肺癌、乳腺癌和膀胱癌的早期诊断、治疗及其癌变机理研究等。2000年以来，由我科承担和主要参与的国家、北京市和院所的各项科研课题近40项；获得各类奖励15项；发表及参与发表论文130余篇；主编和参与编写学术专著20余部。
　　本科室有编制内人员45名，其中特聘专家2名，教授8名，副教授7名。