海军总医院肝胆外科是北京地区第一批成立肝胆专科的单位，主要进行肝脏、胆道和胰腺疾病的外科治疗。在国内较早开展了肝脏半肝、三叶及肝门部肿瘤切除手术、胰十二指肠切除等高难度手术，同时在复杂胆道疾病的治疗积累了一定的临床经验。科室现有高级职称专业技术干部5名，具有硕士学位以上者6名。年均门诊量4000 余人次，年均收治患者400余人次，年均开展各类手术300余台次。近年来，获军队医疗成果一等奖1项，二等奖1项，三等奖4项。科室拥有实验室2个，并拥有先进的十二指肠子母镜、胆道镜、酸标仪、杂交仪等一批先进设备。解放军总医院黄志强院士受聘长期指导科室的临床工作。科室讲求工作作风，对患者认真负责，同时注重临床科研攻关，在军内外取得了较好的声誉 。