中国医学科学院阜外心血管病医院肺血管病诊治中心成立于２００３年４月，其前身是成立于１９７２年的肺心病研究室及１９９７年曾更名的心脏肺循环研究室。肺血管病诊治中心是心血管病内科学范畴的直接隶属于院所领导下的临床诊疗中心，设有肺血管病专科门诊和专科病房（五病区），现有特聘著名专家１名、教授（主任医师）２名、副教授（副主任医师）２名、中心秘书１名，其中博士生导师１名、硕士生导师２名。
　　肺血管病诊治中心不仅诊治各种心血管内科疾病，更以其收治各种肺血管疾病如肺栓塞、肺动脉高压、右心疾病等方面的独特之处而闻名于全国。肺血管病诊治中心在全院兄弟中心如成人心脏外科中心、放射科、核医学科、超声科等部门帮助和支持下，全院各种肺血管病的诊治技术综合实力在全国处于领先水平，在某些方面达到国际先进水平。在全国首先建立了肺血管病影像学诊断方法和诊断标准；１９７４年诊断了第一例无心肺疾病的肺栓塞患者；１９９０年开展了首例急性肺栓塞溶栓治疗，１９９７年开展了首例慢性血栓栓塞性肺动脉高压肺动脉内膜剥脱外科手术治疗。１９９７年至１９９９年开展了首次全国肺栓塞多中心临床试验。为引导全国肺血管病的发展、提高我国肺血管病防治水平、推广普及肺血管病诊疗技术做出了重大贡献。
　　肺血管病诊治中心曾承担了多项科学研究基金项目，如国家“七•五”、“八•五”、“九•五”、“十•五”重点科技攻关项目、国家自然科学基金项目、卫生部科学基金项目、首都医学发展基金项目、中国医学科学院科学基金项目以及其他合作研究项目。取得了丰硕的研究成果，获国家科技进步奖一项、全国医药科学大会奖六项、卫生部科技进步奖四项、北京市科技进步奖一项、中华医学科技奖一项、中国医学科学院医疗科技奖八项。发表论文３００余篇，编写专著八部。
　　肺血管病诊治中心培养了几十名博士研究生和硕士研究生，毕业研究生遍布国内外，取得了可喜的成绩。此外，还培养了一批又一批来自全国各地的心内科进修医师和专科进修医师。
　　肺血管病诊治中心的创立和发展经历了几代人的努力。在著名专家蔡如升教授、程显声教授等老一辈专家的创业和领导下，曾经取得令人瞩目的成就，在全国学术界处于领导地位，有过辉煌的历史。然而，目前肺血管病诊治中心面临的机遇与挑战并存，中心的全体人员肩负着调整、改革、发展、重铸辉煌的重任。