口腔科是空军总医院成立较早的一个科室，技术力量雄厚，设备先进，拥有多名高学历高职称医护人员，目前门诊共有进口口腔综合治疗椅18张及其它进口设备，口腔病房展开床位8张，年门诊量3万余人次，年收容量140余人。主要收治各种口腔牙体及牙周疾病、口腔感染、口腔外伤、口腔肿瘤、口腔修复、口腔正畸等口腔常见病及多发病，同时还担负与口腔科有关的急诊、会诊等工作，在口腔修复、口腔正畸等方面处于国内先进水平。近年来，全科共发表学术论文100余篇，获军队科技进步二等奖1项。编写或参与编写学术著作5部。科主任柯杰，口腔医学博士，主任医师，硕士研究生导师，师从我国已故著名口腔医学专家、一级教授陈华多年，曾任第四军医大学口腔医学院正畸教研室（正畸科）副主任，现任全军牙病防治专家组副组长，空军牙病防治专家组组长，北京市口腔医学会委员，空军高科技人才。