消化内科由门诊、内窥镜室、胃肠动力室、消化实验室和消化内科病区等5个部门组成。病区面积约1000平方米，环境整洁优雅，开展41张床位；内窥镜室总面积约800平方米，分设7个检查室，分别进行胃镜、小肠镜、结肠镜、十二指肠镜、胃肠动力检测等检查与治疗。拥有先进电子内镜主机4台，小肠镜1套、各种内镜10余条、800毫安X线机1台及胃肠功能检测仪、8道生理记录仪。临床诊疗优势集中体现在下列几个方面：各种常规内镜诊疗技术（双气囊小肠镜检查及治疗技术在国内居先进水平）、消化系肿瘤的内科综合治疗、胃肠动力障碍性疾病的检测与治疗、重症急性胰腺炎的治疗、不明原因消化道出血的诊断与治疗、小肠疾病的诊断与治疗等。
科室拥有在欧洲学习交流的访问学者和留学美国的博士后各1名，获得博士学位的高层次人才比例占科室医生总数60%以上，集科研、教学与临床于一体，技术力量雄厚。主要研究方向包括：1.小肠疾病的基础和临床研究；2. 消化系肿瘤的综合治疗研究；3.胃癌癌前病变、早期癌的诊断及镜下治疗；4. 肝癌发生发展分子生物学机制及肝癌术后复发预防；5. 胃肠动力性疾病的发病机制及诊治研究。是国内最早开展双气囊电子小肠镜诊治技术的医院之一。近5年在国内外核心期刊上发表论著74篇，被SCI收录9篇，获得军队科技二等奖及三等奖多项。