门诊部由感染门诊和普通门诊组成，集门诊和急诊为一体。在历任主任及全体工作人员的努力下，全面建设不断跃上新台阶。设置有肝炎诊室、急诊室、普通内科、皮肤性病科、妇科、中医科、保健室及消化道、艾滋病、SARS诊室，主要对军队和地方传染病患者进行住院筛查及门诊治疗，并负责传染病的监控和预防，形成了大专科、小综合的鲜明特色。年均门、急诊20余万人次。曾被总后勤部表彰为“基层建设先进单位”，并荣立集体三等功。