传染病研究所组建于1998年12月,下设免疫研究室、病毒研究室、生物工程研究室、基因治疗研究室和动物实验中心,现有博士生导师3人,硕士生导师1人。5年来,学科发展迅速,是全军“重中之重”建设研究所,病毒性肝炎和爱滋病防治实验室为全军重点实验室。目前承担包括国家“863”项目、国家科技攻关计划、国家自然科学基金项目在内的国家、军队、北京市级科研基金项目40余项,在传染病的快速诊断、短程治疗、有效预防上,取得了可喜成绩,有些研究课题还取得了突破性进展。曾获军队科技进步一等奖2项、二等奖9项、北京市科技成果二等奖2项