我科拥有国内先进水平的洁净手术室。手术室分工作区、学习区和生活区。有百级、千级和、万级手术间（现称一级、二级、三级）。一级手术间以骨科手术、心脏、脑科手术为主。二级为胸科、腹部外科。三级为妇产科、五官科手术间。手术床设置为每个手术间一台，全为电动。手术间设有进口可升降和旋转式吊塔，配备多个电源插座和气源插座（墙壁另有气源和电源插座）。麻醉机分别为北美Drager 2B、Detax-Ohemda和CiceroEM，.多功能监护仪，能作麻醉气体及呼吸末CO2监测,其中一台可做有创血流动力学监测。