北京军区总医院心肺血管病中心于2005年2月由北京军区总医院心血管内科和外科整合而成，2006年1月在心肺血管病中心的基础上成立北京军区心肺血管病研究所，由国际著名的心脏病学家胡大一教授担任所长、中心主任，张永教授担任副所长，姚建民教授担任心血管外科主任，王显教授担任心血管内科主任。现展开床位110张，分为心血管一区（心血管外科）、心血管二区（心血管内科）和心血管三区（心血管病重症监护病房）三个病区，共有医、护、技工作人员105人，其中高级技术职称21人，博士后、博士和硕士25
人，曾在国外著名心血管病中心工作和学习者11人。拥有国际一流的心血管造影机、射频消融仪、主动脉内球囊反搏机、呼吸机、心电监护仪等国际先进的医疗设备5000多万元。中心的各部门密切协作，内外科联合出门诊、联合查房、联合讨论病例，为患者选择最佳诊治方案。研究所下设冠心病研究室、预防心脏病学研究室、先心病研究室、临床药理研究室、血栓与栓塞研究室和中心实验室等机构。
北京军区心肺血管病研究所和心肺血管病中心瞄准国际发展前沿，紧跟国际发展最新动态，努力开拓创新，开展了心血管病急救绿色通道、冠心病介入治疗、经皮房室间隔缺损和动脉导管未闭伞堵术、经皮二尖瓣和肺动脉瓣球囊扩张术、室上速和心房颤动经导管消融术、永久起搏器和体内自动除颤器植入术、经导管腔静脉滤器植入术、肾动脉等外周动脉支架术，冠状动脉搭桥术、室壁瘤切除与几何成型术、瓣膜成型与置换术、复杂先心病畸形矫正术、动脉瘤切除人工血管置换和带膜支架腔内隔离术、心脏移植术等新技术新业务。研究所心血管内科分别于2005年、2006年被第二军医大学、第三军医大学授予“十五”教学先进单位。研究所累计完成和承担国家、军队和北京市科研课题20余项，目前在研国家自然科学基金项目2项，在国内外学术期刊累计发表论文1000余篇，编写专著70多部，获得国家、军队和北京市科技进步与医疗成果奖30多项。