病理科组建于1974年，为临床病理与实验病理相结合的病理科，是军事医学科学院病理专业研究生、科技人员进行临床病理研究的实验室，长年接受来自军内、外的病理专业进修生，多年来从事肿瘤病理学、放射损伤病理学及造血干细胞移植病理学的实验研究及临床病理诊断，具有丰富的肿瘤病理学和移植病理学基础。在国内首先报道了急性肠型放射病，亚急性放射病的全面、系统的病理学研究，先后发表论文六十余篇，获军队科技进步三等奖两项。科室现有主任医师、副主任医师、主治医师各1名，住院医师2名，主任技师1名，主管技师1名，技师3名。