肿瘤学研究室（肿瘤分子生物学研究室）成立于1996年，是军事医学科学院的重点研究室，也是肿瘤诊治中心实验室。该研究室以基础研究与临床结合为宗旨，致力于基础研究成果向临床应用的转化，主要方向是通过肿瘤标志物的筛选研究，建立肿瘤早期诊断、疗效评估以及预后预测的量化分子检测标准。多年来科室曾获得重要课题多项，分别包括：国家“863”课题、国家自然科学基金重点与面上课题、国际原子能委员会资助课题、省、部级课题等。研究成果包括：军队科技进步二等奖以及北京市科技进步奖多项。多次邀请、接待了国内外专家的讲学并输送大批人才到国外著名科研院所进行访问研究，并为医院内外培养研究生七十余人。目前科室与吴阶平基金会联合成立了“北京临床分子分型诊断实验室”，极大的拓展了科室的业务范围。 免疫学研究室自1980年成立，主要从事免疫遗传、移植免疫、造血干/祖细胞生物学特性、免疫耐受及肿瘤的分子导向杀伤等方面的研究。是国内最早、规摸最大、实力最强从事HLA结构与功能研究的单位之一，也是目前国内唯一通过国家科技部“认证、认可”的国家生物医学分析中心HLA专业研究室，在HLA分子结构与功能、HLA移植免疫、HLA与疾病相关性的研究领域处于国内领先、国际先进水平。尤其是近年来在HLA三维空间结构预测GVHD发生、CD34+ 造血干/祖细胞的分子生物学特征、造血生长因子的克隆表达及生物学特性、能特异性诱导免疫耐受的新型重组蛋白的分子设计与构建研究以及类风湿性关节炎新型基因疫苗的研究中中取得突破性进展。先后承担过十几项国家“973”、国家自然基金重点项目、国家自然科学基金、国际合作基金及省、部级基金，均高质量圆满按时完成，并获得多项军队、省部级科技成果奖及国际合作奖。主要成员较长期从事实验血液学、分子生物学、免疫学的相关研究，具有丰富的实验室研究经验。并且具有精良的设备。