消化肿瘤内科主要进行消化道肿瘤的术后辅助化疗、放疗、分子靶向治疗，以及不能手术的、复发转移病人的抗肿瘤解救治疗。该科根据个体肿瘤病人生物学特性的差异，合理安排病人的治疗。努力探讨临床肿瘤治疗的个体化。在国内创建了具有临床实用价值的"人肿瘤体外药敏试验",并指导晚期肿瘤病人的预见性化疗,使一批难治性复发转移肿瘤的治疗效果得到明显提高。近来，首次开展通过化疗药物作用靶酶的变化，来优化消化道肿瘤临床化疗方案的研究，得到国际同行的认可。对新近出现的肿瘤靶向治疗，进行了系统的研究。尤其是通过开展EGFR酪氨酸激酶抑制剂与化疗联合机制的探讨，在国际上首先发现了EGFR靶向药物对化疗作用的调控规律，提出了EGFR靶向药物未来临床应用的新思路，受到意大利、美国有关肿瘤专家的好评。为临床肿瘤化疗的个体化、联合用药的合理性提供了依据。该科承担多项国内外抗肿瘤新药的研究，为难治性、复发转移的消化道肿瘤患者创造了更多的、有效的治疗机会。目前与意大利NCI、美国华盛顿大学等研究机构和医院协作，参加消化道肿瘤的国际性研究课题两项。在国内核心期刊上发表论文数十篇，在国际肿瘤专业的权威杂志上发表论文10余篇，参与编写专著<< 实用肿瘤治疗学 >> 1部。获高等级医疗成果1奖。 肿瘤二科是一个具有很强的肿瘤综合治疗能力且同时拥有一支团结敬业、技术精湛的医疗护理队伍的专业临床科室。恶性淋巴瘤的诊治是我科传统优势特色，实践经验丰富，疗效突出，集临床诊治、科学研究和人才培养为一体。收治了来自全国的大量淋巴瘤病人，许多疑难病例在此得到确诊和完善的治疗，同时纠正了许多外院误诊病例。我科是国内少有的能够将淋巴瘤放疗、化疗、生物靶向治疗、造血干细胞移植等多种治疗融为一体、并独立完成上述治疗的专业淋巴瘤诊治科室，这样不仅使病人来到后可以安心治疗，避免了反复转科等床的烦恼，更可以科学合理、系统周密地根据患者病情考虑和安排综合治疗计划，适时的进行最佳方案选择，减少了因学科壁垒造成的治疗机会丧失，从而得以达到最佳疗效，从而使我科在恶性淋巴瘤诊治水平上位于国内前列。另外，我们还积极研究和开展淋巴瘤的新法诊疗，培养了许多临床博士、硕士研究生。全科治疗床位40余张，有无菌层流病房，设备完善。
头颈部肿瘤病区 头颈部肿瘤是指从颅底到锁骨上的所有肿瘤，包括耳鼻咽喉、付鼻窦、口腔、唾液腺、头面部和颈部软组织、甲状腺等部位的肿瘤，常见的肿瘤有鼻咽癌、喉癌、口腔癌、上颌窦癌、甲状腺癌等。综合治疗是提高头颈部肿瘤疗效的主要方法。合理选择和应用放疗、化疗、手术、热疗、光动力治疗等现代治疗方法，有序、科学的设计治疗程序是获得最佳疗效的关键。放射治疗在头颈部肿瘤的治疗中有特别重要的意义，本科主任张伟京主任医师综合治疗经验丰富，在放射治疗方面具有很深的造诣，现任全军放射肿瘤专业委员会常务委员，中华医学会北京放射肿瘤学会委员。作为学科带头人，其科室内设头颈部肿瘤病区，多年来治疗了大量头颈部肿瘤病人，取得良好疗效。 成立于1959年，是全国最早成立的肿瘤专科之一。现有高级技术职称3人，硕士研究生以上学历人员占78%，是一支技术精湛、服务优良的医护队伍。
学科以肺癌的综合诊治为特色和发展方向，开展了精确放疗、同步放化疗、靶向治疗、基因治疗、细胞免疫治疗、中药辅助治疗等多种肿瘤治疗手段，实现了循证医学指导下的规范化和个体化综合治疗；与兄弟科室协作开展了γ-刀、射频消融、放射粒子植入、介入治疗等合作治疗项目，力求为肿瘤患者提供最人性化的技术指导和最佳的治疗手段。
作为国家批准的抗肿瘤药物临床试验单位，共承担国际、国内抗肿瘤新药临床研究40余项，这些新药临床研究在第一时间把国际、国内抗肿瘤治疗的最新药物带给患者。