瑞金医院呼吸科始建于20世纪50年代初。在中国著名肺脏病学专家孙桐年、胡曾吉、邓伟吾、黄绍光等教授的带领下，科室长期从事呼吸系统疾病临床、科研和教学任务，在实践中不断进步，不断创新，在多种呼吸系统疾病的诊治中都创立了自己的特色，如慢性气道疾病（支气管哮喘，慢性阻塞性肺疾病），肺部肿瘤，呼吸重症监护和治疗，睡眠呼吸障碍疾病的诊治，肺间质疾病，肺结核及其他肺部及胸腔疾病等。