上海第二医科大学附属瑞金医院肾脏专业始建于1965年，1976年成为一个独立的科室，现下设临床、病理、实验室及透析室4个部门，是国内成立最早、配置最完善的肾脏专科之一，并为上海市卫生局医学领先专业重点学科。
目前全科有肾脏专科医生20人，包括正教授3人，副教授10人，主治医生3人，住院医生4人，其中90%以上医生具有硕士或博士学历，约50%医生在英、法、美、日等国学习深造，已形成了一支"奉献、合作、进取"的中青年医师梯队。病房有50张固定床位，进口透析机22台，血浆置换机1台，床边持续静-静脉血滤机3台，腹透机2台，免疫吸附机1台。
"以病人为中心，提高医疗质量为目标"，一直是我科建设的宗旨。自建科以来，收治大量肾脏病患者，在国内首先报道第一例肾小管性酸中毒（1958年）、肾穿刺确诊的巨球蛋白血症（1992年）和轻链沉淀病（1994年）、遗传性高草酸尿症，发现第一个Liddle综合征以及胶原III肾病家系，至今收集大组的肾小管性酸中毒、原发性肾病综合征、干燥综合征肾脏损害、狼疮性肾炎、坏死性血管炎、异常球蛋白血症、遗传性肾炎等病例，逐渐形成以继发性肾脏损害（狼疮性肾炎、干燥综合征肾脏损害、坏死性血管炎、异常球蛋白血症肾脏损害等）、急慢性肾衰、遗传性肾脏疾病、肾小管间质疾病、肾病综合症等的诊治为代表的医疗特色。在国内首先开展严格设计前瞻性急性肾功能衰竭临床诊治研究，急性肾衰的相关死亡率和治愈率均达到国际水平，相关研究成果先后获中华奖二等奖、上海市科技进步奖一等奖和上海医学科技奖一等奖。我科是国内最早开展血液净化技术的肾脏病科室之一，可进行血透、腹透、血液透析滤过、血浆置换、CRRT、免疫吸附等各种血液净化技术。此外，我科亦是国内最早开展肾穿刺的科室之一，至今已累积近6000多例肾组织标本。肾脏实验室建立了一整套的肾小管、肾小球功能检查，为临床发现及诊断肾脏疾病提供了可靠依据。高超的医疗水平、一流的服务质量，吸引了全国各地的肾脏病患者前来就诊，专科门诊量和住院人数逐年递增，门急诊人数达8~9万人/年，年出院人数超过2000人次。我科先后被评为全国职工职业道德建设"百佳班组"、院校级先进集体等。
肾间质纤维化发病机制及慢性肾衰早期干预措施和遗传性肾脏疾病如Alport综合征、Fabry病、家族性IgA肾病等分子发病机制的研究是我科研究的重点和特色，相关研究成果先后获上海市科技进步一、二等奖、教育部提名国家科学技术奖科技进步奖一等奖等。
作为国内肾脏专业第一批博士和硕士学位授予点，现有博士生导师1人，硕士生导师4人，先后培养博士研究生17人，硕士研究生44人；1人入围上海市卫生系统百名优秀跨世纪带头人培养计划，1人入围上海市青年科技启明星培养计划。先后获24项研究课题，包括国家自然科学基金2项、省部级基金18项、欧共体基金1项等。在国内外知名杂志发表论文300余篇，SCI收录22篇。科内多名成员先后担任许多重要的学术职务，包括曾任国际肾脏病学会亚太地区理事、中华医学会肾脏病学会主任委员、上海肾脏病学会主任委员、现1人担任中华医学会肾脏病学会常务委员、上海肾脏病学会副主任委员，2人担任上海肾脏病学会委员。