普外科胃肠专业是上海瑞金医院实力最强的专业之一，在全国享有广泛的声誉。目前具有博士授予点2个，硕士授予点2个，博士研究生导师4名，硕士研究生导师3名，外科学博士9名，外科学硕士9名，这些国内外知名的胃肠专家教授，在疑难胃肠疾病治疗方面深有造诣。目前承担了多项国家自然基金课题、上海市科委基金的研究。
现有普通床位50张，专业治疗胃肠道疾病，对胃部（胃溃疡、胃癌、胃恶性淋巴瘤、胃间质瘤）及十二指肠疾病的治疗有一定的特色与专长。拥有专业的临床营养医生处理手术病人的外科营养问题，一方面极大程度帮助手术医生解决患者的围手术期营养支持问题，同时也验证了营养治疗这一全新概念的正确性和必要性。外科重症监护室除拥有先进的治疗设备与仪器，还有专门的SICU医生,这些都是术前情况差、术后并发症多的重危病人得以康复的保障。
胃肠专业研究成果先后获得国家科技进步三等奖，卫生部科技进步二等奖，上海市科技进步二等奖，教育部科技进步三等奖，上海市科技进步一等奖，教育部科技进步二等奖等多项成果奖。