2000年我科在东部扩展了病房和门急诊，使全科东西部床位总数从28张增加到86张，每年平均出院病人数由400余人逐年增至1500余人，门急诊人次从每年3万余人增至9万余人，成功抢救和诊治了大量危重和疑难病人，为全市的医疗工作做出贡献。
2006年东部门诊继续进一步扩大，由原先每周3个半天增加到每周5个全天，下午陆续开设了脑卒中，癫痫，帕金森病，记忆障碍，失眠神经症，头痛头晕和肉毒素等专病门诊，进一步规范检查和用药治疗，受到广大病家的欢迎。
随着科室的发展壮大，实验室工作也同步前进，神经电生理实验室配置了24小时动态脑电图、脑电视频监测仪和肌电图等设备，提高了临床诊疗技术；神经生化实验室除了继续开展隐球菌脑膜炎的实验室诊断工作外，建立了检测髓鞘碱性蛋白(MBP)水平诊断脱髓鞘疾病的实验室诊断方法；并正在探索与脑血管疾病的发生与治疗相关联因子（生化、血液、遗传、免疫）及其检测方法；开展了神经干细胞培养及分化机制的研究，神经病理实验室在原有基础上继续发挥肌病特色，成立了肌病中心，经过几年的努力逐步完善了组织构建、人员培训的实质性建设。
这七年来，神经内科的年轻医务人员在发展中经受锻炼，迅速成长，老中青结合的人才梯队逐渐完善。培养了博士2名、硕士11名、输送了1人去国外进修学习，另外在职研究生有8名，在读培养研究生6人。医师队伍学历层次也显著提高，具有硕士以上学历的人数从2名（9%）上升到25名（83%）。目前科内有教授2名，副教授8名，主治医师11名。
神经内科自1980年开始受国家卫生部委托举办全国神经科进修班之后，每年不间断地办班，至今已举办了27期，近七年中培训全国各地进修医师100余名。此外，还连续举办国家级继续教育项目“神经内科知识进展学习班”和“肌电图学习班”共6期，并培训了3名高级医师进修班学员。
在医学科学日新月异的时代，神经内科注重于科研进步。自1999年以来,立项并已完成的科研课题有"西比灵对缺血神经细胞保护作用的研究"、"实验性神经细胞缺氧后PARP的动态变化及西比灵对PARP的影响"、"速避凝对急性缺血性脑卒中患者外周血细胞粘附分子作用的研究"、"GABA受体mRNA与癫痫发病机制相关性实验研究"、“缺血再灌注后大鼠脑内基质金属蛋白酶的动态变化"以及"多巴胺转运蛋白显像与帕金森病的早期诊断"。目前正在进行的课题有市科委重大攻关项目（脑卒中的二级预防）、“肉苁蓉抗神经细胞衰老的活性成分研究"。2005年来，我科积极申请各级各项科研经费，目前承担国家十一五重大公关课题子课题一项，上海市卫生局课题一项。
2004年我科承办主编《神经病学与神经康复学杂志》刊物。2000年以来我科在国内外各级杂志上发表论文110余篇。
2001年来我科积极申报国家临床药理基地，陆续参加了SAINT-II，FAST，PROFESS，CSPS，CRESCENDO，INTERACT，INVENT等国际国内多中心临床药物验证研究。
七年来，神经内科伴随着仁济医院的发展逐渐成长。面对机遇与挑战，神经内科将继承和发扬“仁术济世”的精神，提出“勤奋 团结 求新 争创一流”的科室新风，抓住机遇，迎接挑战，再接再励，争取更大的进步。

历任科主任：周孝达、蔡琰、沈崇欣（代）、曹慧兮、苗玲。