早在四十年代上海市第一人民医院就设立了呼吸科病房，在历任科主任的带领下，呼吸科由小到大、由设备简单到设备先进、功能齐全，目前呼吸科已发展有呼吸重症监护室、肺功能室、纤维支气管镜室，开展的临床、教学、科研工作取得了很大的成绩，已跻身于国内先进行列。

目前主要研究方向包括（1）器官移植术后以及慢性疾病的呼吸道感染性疾病的流行病学研究和机制研究；（2）慢性气道疾病的发病机制；（3）呼吸衰竭和诊治与基础研究；（4）呼吸康复的机制与临床评价；（5）肺癌的机制研究。

目前，本学科以40岁以下的年轻人为主体，现有教职员工14人，其中教授（主任医师）4人、副教授（副主任医师）4人。本学科十分注重在学科发展中培养人才，在人才培养中发展学科，每年送出1-2名青年教师赴国外参加学术会议或合作单位学习。

本学科已经建立了细胞生物学、生物化学和分子生物学实验技术体系，拥有设备完善的实验室，包括电泳仪、PCR仪、离心机等仪器设备。在研项目包括市科委项目一相，中华医学会项目1项，市局级项目2项，其他横向联合项目多项，总研究经费达30万元。最近三年来，近五年来呼吸科在国内外发表学术论文60余篇，在国内外呼吸学术会议上交流十余篇。呼吸科目前有博士生导师2名、硕士生导师1名 。在读博士生1名、硕士生5名。